Filhan edeltäjän Suomen tuberkuloosin vastustamisyhdistyksen (STVY) ensimmäinen suuri kansainvälinen projekti oli vuosina 1980-1990 Somaliassa toteutettu tuberkuloosihanke.

Vuodesta 1997 Filha on toiminut Maailman terveysjärjestö WHO:n yhteistyökeskuksena tuberkuloosin torjunnassa ja hoidossa. Filha on myös Kansainvälisen tuberkuloosi- ja keuhkosairausunionin (IUATLD) yhteistyökeskus vuodesta 2001.

Vuodesta 1997 Filha on toteuttanut tuberkuloosihankkeita Baltian maissa ja Luoteis-Venäjällä: Murmanskin ja Leningradin alueilla, Karjalan tasavallassa ja Pietarin kaupungissa. Tuberkuloosiyhteistyössä Filhan toiminta nojautuu WHO:n suosittelemaan Stop TB -strategiaan.

Siviilisektorin tuberkuloosihankkeiden lisäksi Filha toteuttanut Norjan terveysministeriön rahoittaman hankkeen Murmanskin alueen vankiloissa osana laajempaa Barentsin alueen terveysyhteistyötä. Filhan asiantuntijat ovat lisäksi toimineet konsultteina oikeusministeriön yhteistyöhankkeessa Pietarin ja Leningradin alueen vankeinhuolloin kanssa vuodesta 2002 lähtien.

Filha toimii myös Keski-Aasiassa ja toteuttaa vuosina 2007-2009 WHO:n Practical Approach to Lung Health (PAL) -strategiaan perustuvaa keuhkoterveyshanketta Kirgisiassa.

Filha osallistuu aktiivisesti tuberkuloosikoulutuksen kehittämiseen. Yhdistys osallistui 1990-luvulla kansainvälisten tuberkuloosikurssien järjestämiseen Arushassa Tansaniassa ja vuodesta 1996 Filha on järjestänyt kansainvälisen tuberkuloosikurssin Tartossa ensisijaisesti Euroopan korkean tuberkuloosi-ilmaantuvuuden maista tuleville lääkäreille. Hoitajille on järjestetty tuberkuloosikoulutusta vuodesta 2001 Tartossa ja Tallinnassa ja vuodesta 2006 Murmanskissa. Keväällä 2009 Tarton kurssikokonaisuuteen liitetään uusi tuberkuloosikurssi Euroopan matalan ja keskisuuren ilmaantuvuuden maista tuleville lääkäreille. Vuonna 2008 pidettiin ensimmäinen tuberkuloosi-infektiokontrollikoulutus Murmanskissa ja Luoteis-Venäjän tuberkuloosilaboratorioiden johtajien koulutusseminaari Pietarissa.

Tuberkuloosihankkeiden lisäksi Filha on toteuttanut kansainvälisiä astmahankkeita Kiinassa ja Mongoliassa. Vuodesta 2007 Filha on tehnyt yhteistyötä Venäjällä Murmanskin alueen kanssa keuhkoahtaumataudin hoidossa ja torjunnassa.

Filhan kansainvälisiä hankkeita on rahoitettu ulkoasiainministeriön kehitysyhteistyö- ja lähialueyhteistyömäärärahoista.